ubuntu升级R+RMySQL+manpage

发布时间：2014-09-05 14:06:45作者：知识屋

试了好些方法，以下成功了，记下备用

sudo apt-add-repository -y "deb http://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu `lsb_release -cs`/"

sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E084DAB9

sudo apt-get update

sudo apt-get install r-base-dev

在R中加载DBI,RMySQL两个包，并使用dbConnect函数设置好用户名和密码

library(RMySQL)

con <- dbConnect(MySQL(),

user='abc', ＃用户名

password='abc', ＃密码

dbname='abc', ＃要使用的数据库名称

host="localhost") ＃主机地址

dbListTables(con) ＃列出所有数据库中的表

＃运行sql语句并返回数据到R

data <- dbGetQuery(con, "select * from abc")

SQL查询可以通过dbSendQuery或dbGetQuery传给数据库管理系统。dbGetQuery传送查询语句，把结果以数据框形式返回。dbSendQuery传送查询，返回的结果是继承"DBIResult"的一个子类的对象。"DBIResult"类可用于取得结果，而且还可以通过调用dbClearResult清除结果。函数fetch用于获得查询结果的部分或全部行，并以列表返回。函数dbHasCompleted确定是否所有行已经获得了，而dbGetRowCount返回结果中行的数目。如果只是简单的读整个表，也可以用dbReadTable函数。

在设置连接时会在R语言环境中明文标示了数据库用户和密码，为了安全起见，可以作如下设置：

在本机目录中定义一个配置文档（ ~/.my/cnf），例如定义两个使用MySQL的用户组：

[local]

user = root

password = ultra_secret

host = localhost

[toto]

user = capitaine_flam

password = galaxy

host = milky.way.net

然后在R中使用用户组：

library(RMySQL)

con <- dbConnect(MySQL(), group='toto', dbname="user_profile")

m <- dbGetQuery(con, "SELECT DISTINCT user_id FROM demographics WHERE gender='0'")

dbDisconnect(con)

另外R连接mysql会出现中文乱码变问号情况，查到COS上一个贴子，解决方案如下：

在MySQL的配置文件/etc/mysql/my.cnf中[client]标签下加default-character-set=utf8

MySQL:

一旦安装完成，MySQL 服务器应该自动启动。您可以在终端提示符后运行以下命令来检查 MySQL 服务器是否正在运行：

1 sudo netstat -tap | grep mysql

讲数据文件权限更改位所有用户可读写

chmod ugo+wrx **.csv

csv导入mysql

load data infile "/tmp/**.csv" into table 表名 fields terminated by "," lines terminated by '/n';

mysql导出到csv

select * from 表名 into outfile "/tmp/**.csv" fields terminated by "," lines terminated by '/n';

内连接：

select zgc_user_age.product_no,zgc_user_age.age from zgc_user_age inner join zgc_user_day on zgc_user_age.product_no=zgc_user_day.product_no into outfile "/tmp/zgc_age_day.txt" fields terminated by "," lines terminated by '/n';

ubuntu的函数手册页不全，自己安装：

sudo apt-get install glibc-doc

man -k pthread或apropos pthread可以查找到当前manpages中关于pthread的手册

sudo apt-get install manpages-posix manpages-posix-dev

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